以日本著名文学家坂口安吾所作《明治开化安吾捕物帖》为蓝本，将这部时代剧作品放置在近未来舞台大胆重现的原创作品，讲述侦探二人组：被称为最后的名侦探的结城新十郎，以及他的搭档——不可思议的美少年因果的故事。

该动画承接《神探四豆星Ⅱ》的故事，继续讲述四位小侦探们解决星球上发生的离奇案件的故事。

照井龙与亚树子开始了婚后的甜蜜生活，但最近发生了连续杀人案件，紧急受命的龙参与到了案件的调查中。此时，刃野警官却遭到枪击伤重倒下了，而龙则莫名被当成了嫌疑人！深陷危机的龙不得不与掌握着案情关键线索的女惯偷——葛木葵一起躲避追捕，加速记忆体被夺走的龙也无法变身成假面骑士！不仅如此，因为亚树子得知了龙与别的女人一起逃亡而愤怒不已，龙还面临着离婚危机？！敌人不断袭来，龙能否冲破困境化险为夷呢？

冲锋车案件主谋李家俊设计逃脱警方控制，与幕后黑手汇合，联手策划更大阴谋而现警务处长刘杰辉，前警务副处长李文彬，和资深大律师简奥伟被卷入其中，香港将面临更加大的危机…