纽约大战后，雷神索尔将弟弟洛基带回仙宫囚禁起来，此外帮助九大国度平定纷争，威名扶摇直上。虽然父王奥丁劝其及早即位，但索尔念念不忘地球的美丽女孩简·福斯特。与此同时，简在和黛西及其助手伊安调查某个区域时意外被神秘物质入侵，却也因此重逢索尔，并随其返回仙宫。令人意想不到的是，藏在简体内的物质来自远古的黑暗精灵玛勒基斯。在“天体汇聚”的时刻再次到来之际，玛勒基斯企图摧毁九大国度，缔造一个全然黑暗的宇宙。 藏匿简的仙宫受到重创，而索尔和洛基这对冤家兄弟也不得不联手迎战宿命的强敌……

2051年，自革新者事件已过了一年。即使经历苦恼、悲伤亦持续战斗将事件解决。因而大幅度成长的山野阪，以作为阿堤密斯冠军的身份参与LBX对战。但某日，全世界的LBX突然失控并开始攻击人们，神秘的恐怖活动组织“探測者”对全世界发出宣战公布。阪痛失爱机奥丁，好朋友亚美跟和也被发现者诱拐。同时与他的新同伴大空弘、花咲兰命中注定的相遇，再次为拯救世界而投身战斗。２０５０年、ホビー用小型ロボット『ＬＢＸ』は爆発的なブームとなっていた。ＬＢＸの戦場、それはあらゆる衝撃を吸収してしまう未来の箱、『強化ダンボール』の中だっ